Multi-Omics Database

水稻多组学数据库

整合基因组、表型组、代谢组的多维数据枢纽
Integrated Multi-Omics Data Hub for Rice Research
12TB+
数据总量
8
数据库类型
50K+
基因条目
200+
表型指标
Database Categories

数据库总览

八大核心数据库，覆盖水稻研究的全维度数据需求

🧬
基因组数据库
50K+
全基因组测序、基因注释、SNP变异数据
🌱
表型组数据库
200+
形态、生理、产量等多维度表型指标
🔬
代谢组数据库
10K+
代谢物定性定量及代谢通路信息
📊
转录组数据库
30K+
基因表达谱、转录因子及调控网络
🐛
病虫害数据库
80+
病虫害图谱、症状识别及防治方案
🌾
种质资源库
5000+
水稻品种资源及遗传背景信息
🌍
环境数据库
15年
气象、土壤、地理等环境因子数据
📚
文献知识库
10万+
水稻研究文献、知识图谱与实体关系
🖼️
图像数据库
100万+
田间、实验室多尺度图像标注数据
Data Architecture

数据分层架构

从原始数据到知识应用，五层架构保障数据质量与可用性

L1
原始数据层 Raw Data
测序原始数据、图像原始文件、传感器原始读数等未经处理的一手数据
FASTQ 测序文件 RAW 图像 传感器日志 田间记录表
L2
清洗标注层 Cleaned & Labeled
经过质量控制、去噪、标准化和人工标注的数据，可用于模型训练
QC 后测序数据 标注图像集 标准化表型值 结构化文献
L3
特征工程层 Feature Layer
提取的生物学特征、图像特征、文本特征，支持多模态融合分析
基因表达特征 视觉特征向量 表型指标特征 文本 Embedding
L4
知识图谱层 Knowledge Graph
构建实体关系网络，包含基因、蛋白、代谢物、性状、疾病等节点及关联
基因-性状关联 代谢通路网络 病虫害知识 品种谱系图
L5
应用服务层 Application Layer
面向智能体和下游应用的 API 服务，提供检索、问答、预测等能力
向量检索 API 知识问答 API 图像分析 API 预测模型 API
Database Details

数据库详情

各数据库的规模、来源及更新状态

数据库名称 数据规模 数据来源 更新频率 状态
基因组数据库 50,000+ 基因 / 300 品种 NGS 测序、公共数据库 季度更新 已上线
表型组数据库 200+ 指标 / 10 年数据 田间试验、实验室测定 月度更新 已上线
代谢组数据库 10,000+ 代谢物 LC-MS / GC-MS 检测 季度更新 已上线
转录组数据库 30,000+ 转录本 / 50 组织 RNA-seq、芯片数据 季度更新 已上线
病虫害数据库 80+ 病害 / 50+ 虫害 专家标注、文献整理 年度更新 已上线
种质资源库 5,000+ 品种 种质库、育种材料 年度更新 建设中
图像数据库 1,000,000+ 张图像 田间采集、无人机、实验室 月度更新 建设中
文献知识库 100,000+ 篇文献 PubMed、CNKI、知网 月度更新 已上线

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